Nalazite se
  • Zdravlje
  • One Codex će biti Google za pretragu DNK
Članak
Objavljeno: 16.08.2014. 13:38

DNK tražilica 

One Codex će biti Google za pretragu DNK

Ova tražilica predstavlja search engine podataka vezanih uz genomiku, važnih za kliničku dijagnostiku.

One Codex će biti Google za pretragu DNK

Računalni znanstvenik Nick Greenfield i njegov kolega s doktoratom znanosti genomike Nik Krumm, pomalo podsjećaju na osnivače Googlea Sergeya Brina i Larrya Pagea, no umjesto tražilice općih pojmova, njihov search engine pod nazivom One Codex, namijenjen je pretraživanju DNK.

Ne tako davno, sekvencioniranje vašeg genoma je predstavljalo skup i složen postupak, dok je praktično korištenje dobivenih podataka bilo zanemarivo. U današnje doba proces je postao znatno jeftiniji i dostupniji svim "smrtnicima", no iskoristivost podataka je i dalje vrlo upitna stvar.

Postojeći algoritam za pretraživanje genoma pod nazivom BLAST je prilično spor, pa su Greenfield i Krumm izradili svoj pod nazivom One Codex, koji predstavlja genetsku platformu za pretraživanje koja je 1.500 puta brža od konkurentskih rješenja.

Tražilica se trenutno nalazi u otvorenoj beta fazi, no inicijalni testovi već su pokazali veliku učinkovitost novog algoritma.

Prema riječima autora, u bazi podataka tražilice trenutno se nalazi oko 30.000 bakterija, virusa i gljivica, pa je One Codex već sada izuzetno brz i efikasan alat koji ponajprije stoji na raspolaganju medicinskoj dijagnostici.

"Umjesto korištenja specifičnog testa za tuberkulozu, liječnik će uzeti uzorak, sekvencionirati ga i pretvoriti biologiju u podatke", navodi Nick Greenfield. "Nakon toga će se podaci ubaciti u tražilicu koja sadrži sve moguće patogene, pa će vam reći imate li uopće tuberkulozu, koji tip, pa čak i je li ta vrsta tuberkuloze otporna na antibiotike".

Znanstvenici kažu kako ova tražilica možda neće biti toliko popularna za osobnu uporabu kao Google, no svakome će biti drago što postoji. 

Izvor: One Codex

Vezani sadržaji
Komentari

Učitavam komentare ...

Učitavam













       

*/-->